提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
(文图:赵筱尘 巫邓炎)
[责编:天天中]
阅读剩余全文()
视觉焦点
火勇厮杀裁判唱戏 库里关键1射好惊险
返还文物归国路为何走了12年
推荐阅读
y39彩票二战德国巨炮重1350吨炮弹重7吨
2023-10-30
y39彩票 丹麦首富痛失3个子女
2023-07-30
y39彩票京网文【2017】10231-1151号
2023-11-01
y39彩票苏新平同名艺术展:用艺术重构心灵风景和精神家园
2024-01-25
y39彩票研究生院应以支撑国家战略为发展重点
2024-02-21
y39彩票特朗普打了这个电话后 国际油价“闪崩”
2024-02-21
y39彩票物理老师成现象级网红 做科普视频一年半粉丝千万
2023-08-26
y39彩票总决赛-广东2-0领先新疆
2024-01-11
y39彩票宋文帝刘义隆被亲生儿所杀
2023-06-10
y39彩票【福利社】天天都有神券限时限量等你抢
2023-10-07
y39彩票解锁春日“帽子戏法” 你可以向倪妮“取经”
2023-09-10
y39彩票比起险胜我更喜欢躺赢 雪佛兰科鲁泽上市四重礼
2024-02-17
y39彩票月光族的福利!这车售价仅6万,省油耐造比帕萨特更值得买
2023-09-21
y39彩票京津冀中短途列车“五一”加车
2023-10-04
y39彩票广电总局电视剧司负责人就《“十四五”中国电视剧发展规划》答记者问
2023-10-29
y39彩票母乳喂养日:张思莱谈喂养
2023-08-06
y39彩票更具诚意和性价比,2019款领克01试驾
2024-02-29
y39彩票 中国055大驱亮相阅兵究竟有多先进?专家给出这样评价
2023-07-25
y39彩票职业年金是什么 入市之后会怎样?
2024-02-11
y39彩票杀滴滴司机学生被诊患抑郁症 有限定刑事责任能力
2023-08-10
y39彩票海淀四道口限竞房定名「天恒·学院里」
2023-10-11
y39彩票晚年欧阳修头戴鲜花游西湖,一首宋词字里行间可见醉翁本色
2024-01-12
y39彩票陕西省委原秘书长钱引安被双开:一再拒绝党组织挽救
2023-08-02
y39彩票 加拿大女子等两年已成癌症晚期
2024-03-19
加载更多 y39彩票地图